2000 yılında Doğan Akaryakıt adı altında madeni yağ ve akaryakıt sektöründe iş hayatına atıldı. Gayrimenkul şirketlerinin yönetim kurulu başkanlığı görevini de üstlenen Doğan, 2014 yılında enerji sektörüne adım atan Oltan & Köleoğlu Enerji Yönetim Kurulu Başkanı oldu. Trabzon Sanayici İş Adamları Derneği ile Oltan Vakfı Yönetim Kurulu Üyesi olan Doğan, bir dönem Trabzon Ticaret ve Sanayi Odası Başkan Yardımcılığı görevini ifa etti.
8 Nisan 2018'de Trabzonspor Kulübü Yönetim Kurulu üyeliğine seçildi, Başkan Yardımcısı olarak görev yaptı. İlk olarak 2023 Mart ayında Başkan seçilen Doğan, 1 Aralık 2024'deki Olağan Seçimli Genel Kurul’da Trabzonspor’umuzun yeniden başkanı oldu.
Ertuğrul Doğan evli ve 2 çocuk babasıdır.
